Magister Hukum Ekonomi Syariah (M.HES) semula bernama Magister Hukum Islam (MHI) Sekolah Pascasarjana Universitas Muhammadiyah Surakarta berdiri tahun 1996 dengan nama Program Magister Studi Islam (PMSI) berdasarkan SK Menteri Agama RI No.569/1996 dengan mengelola 5 konsentrasi yakni Pendidikan Islam, Sosial Politik Islam, Sosial Budaya Islam, Hukum Politik Islam dan Filsafat Islam. Pada pengajuan perpanjangan ijin tahun 2008, oleh Departemen Agama Republik Indonesia PMSI dimekarkan menjadi 3 (tiga) program studi, yakni Program Studi Magister Pendidikan Islam (M.PdI), Program Studi Magister Pemikiran Islam (M.PI), dan Program Studi Magister Hukum Islam (M.HI).